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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
21/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; BRAGA, I. de O.; RODRIGUES NETO, J. C.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; VALADARES, L. F.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; VIVIANNY NAYSE BELO SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; ÍTALO DE OLIVEIRA BRAGA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; JORGE CANDIDO RODRIGUES NETO, Instituto de Química, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; LEONARDO FONSECA VALADARES, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Integration of metabolomics and transcriptomics data to further characterize Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth under high salinity stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Genome, e20182, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response. MenosSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and gen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adaptation; Salinization protocol. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230514/1/The-Plant-Genome-2022-Integration.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 161 | |
| 1. |  | WASSERMAN, M. A. V.; VIANA, A. G.; SILVA, M. M. da; BARTOLY, F.; PEREIRA, T. R.; VIVONE, R. J.; FERREIRA, A. C. de M.; PEREZ, D. V. Analysing the behaviour of 90Sr and stable Sr in highly weathered soils: soil to plant transfer factor and geochemical partitioning. Journal of Environmental Radioactivity, v. 271, 107319, Jan. 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 2. | | EGITO, A. S. do; GONÇALVES, M. C.; EVANGELISTA, M. E. M.; SOUZA, T. de L.; SILVA, J. A. da; SILVA, M. M. C. da; FELISBERTO, N. R. de O.; CAVALCANTI, M. T. Processamento de queijo muçarela de leite de cabra pelo método de fermentação. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2023. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Comunicado Técnico, 209). SELOS ODS 2, 8, 9, 12, 17.| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | GIRALDI, T. R.; COSTA, B. C. da; SILVA, M. M.; SANTOS, A. L. dos; PARIS, E. C.; FIGUEIREDO, A. T. de; RODRIGUEZ, R. P. Nb2 O5 Pellets with Inactive Biomass for Adsorption of Mn2+ Ions: Kinetic, Isothermal and Reuse Study. Materials Research, v. 26 (suppl. 1), e20220553, 2023. 9 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 5. | | LAGO, L. O.; SWIT, P.; SILVA, M. M. da; BIASOTO, A. C. T.; WELKE, J.; MONTERO, L.; HERRERO, M. Evolution of anthocyanin content during grape ripening and characterization of the phenolic profile of the resulting wine by comprehensive two-dimensional liquid chromatography. Journal of Chromatography A, v. 1704, article 464131, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 6. | | ANDRADE, D. da S.; SILVA, M. M. da; OLIVEIRA, C. L. de; LEAO, P. C. de S.; CORREIA, F. C.; ANTONINO, A. C. D.; ALVES, M. F. de A. T.; LOPES, M. H. L.; LIMA, J. R. de S. Evapotranspiração, coeficiente de cultivo e eficiência no uso de água de uvas viníferas cultivadas no Agreste Pernambucano. Revista Brasileira de Geografia Física, v. 16, n. 3, p. 1376-1386, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | EGITO, A. S. do; GONÇALVES, M. C.; BEZERRA, E. dos; SILVA, M. M. C. da; FELISBERTO, N. R. de O.; CAVALCANTI, M. T.; LAGUNA, L. E.; GONÇALVES, I. C. D. Fabricação de queijos utilizando ervas aromáticas: validação e transferência de tecnologia. Brasília, DF: Embrapa, 2023. 28 p. ODS 2, ODS 9.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | SILVA, M. M. da; WASSERMAN, M. A. V.; WASSERMAN, J. C. de F. A.; PEREZ, D. V.; PEREIRA, T. R.; BARRETO, M. B.; SANTOS-OLIVEIRA, R. Effect of nanomaterials on the bioavailability of metals in sediments from a highly impacted tropical coastal environment. Environmental Nanotechnology, Monitoring & Management, v. 20, 100799, Dec. 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 10. | | MELO, G. W. B. de; RICACHENEVSKY, F. K.; TIECHER, T. L.; GIROTTO, E.; MIOTTO, A.; SILVA, M. M. DA; TRENTIN, E.; BRUNETTO, G. Perspectivas futuras sobre a contaminação em solos de vinhedos, pomares e toxidez em plantas. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo - Núcleo Regional Sul, 2022. p. 405-421| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 11. | | FELISBERTO, N. R. de O.; OLIVEIRA, L. S.; XAVIER, L. H.; SOUSA, M. F. de; ARAÚJO, T. G. P.; EGITO, A. S. do; SILVA, M. M. C. da; CASTRO, M. M.; NASCIMENTO, E. C. S. Diagnóstico da Bacia Leiteira Caprina localizada entre os estados da Paraíba e Pernambuco. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2022. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 150). Selo ODS 15, Selo ODS 16 e Selo ODS 17.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 13. | | FREITAS, V. J. F.; CAMPELO, I. S.; SILVA, M. M. A. S.; CAVALCANTI, C. M.; TEIXEIRA, D. I. A.; CAMARGO, L. S. de A.; MELO L. M.; RÁDIS-BAPTISTA, G. Disulphide-less crotamine is effective for formation of DNA-peptide complex but is unable to improve bovine embryo transfection. Zygote, v. 28, n. 1, p. 72-79, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 14. | | LEAL, W. F. de A.; SILVA, M. M. da; LEAO, P. C. de S.; SANTOS, R. da C.; CARVALHO, D. M. de. Acompanhamento e análise do custo de implantação e produção de uvas viníferas em Garanhuns - PE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 2932-2935.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | ARAUJO FILHO, J. C. de; CORREIA, R. C.; CUNHA, T. J. F.; OLIVEIRA NETO, M. B. de; ARAUJO, J. L. P.; SILVA, M. M. de L. Ambientes e solos do semiárido: potencialidades, limitações e aspectos socioeconômicos. In: XIMENES, L. F.; SILVA, M. S. L. da; BRITO, L. T. de L. (Ed). Tecnologias de convivência com o Semiárido brasileiro. Fortaleza: Banco do Nordeste do Brasil, 2019. cap. 1, p. 19-84.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
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| 16. | | SILVA, F. G. da; MUSSER, R. dos S.; SILVA, M. M. da; LEAO, P. C. de S.; ARAÚJO, J. V. de; ARAÚJO, J. B. de; RAMOS, R. da S. Agronomic aptitude and quality of vinifera grapes in a non-traditional of culture region in the Agreste of Pernambuco States. Journal of Experimental Agriculture International, v. 39, n. 3, p. 1-10, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | SILVA, I. S.; BARROS, A. P. A.; ANDRADE, D. da S.; SANTOS, J. B. dos; SILVA, M. M. da; CAVALCANTE, M. de F. C.; LEAO, P. C. de S.; BIASOTO, A. C. T. Potencial enológico de uvas Vitis vinífera cultivadas no agreste pernambucano brasileiro para a produção de vinhos finos. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 16., 2019, Ica, Peru. Desierto: pasión vitivinícola en Latinoamérica. Ica: Asociacion Peruana de Enologos: Organización Internacional de la Viña y del Vino, 2019. p. 234-240.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | SANTOS, J. B. dos; MELO, I. A. de; CAVALCANTI, M. de F. C.; LEAO, P. C. de S.; SILVA, M. M. da. Caracterização de cachos de viníferas cultivadas na microrregião de Garanhuns - Pernambuco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 1183-1186.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | OLIVEIRA, J. C. de; ROCHA, J. R. do A. S. de C.; SILVA, M. M. da; MAGALHAES JUNIOR, W. C. P. de; ANDRADE, R. G.; MACHADO, J. C. Fenotipagem de alto rendimento em capim-elefante: perspectivas de uso de índices de vegetação obtidos de bandas espectrais do visível na seleção de genótipos superiores. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 23., 2019, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2019. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 234). 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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